Запланировать проверку диска при перезагрузке

Чтобы запланировать проверку файловой системы при перезагрузке, надо в корне этой ФС создать пустой файл forcefsck. Например:

# touch /forcefsck
touch /var/forcefsck
touch /usr/forcefsck
touch /home/forcefsck

При следующей перезагрузке произойдут проверки. Другой вариант -- проверить, что в /etc/fstab для каждой ФС в последней колонке стоит цифра, отличная от нуля. Для корневой ФС -- единица, для остальных 2. После чего выполнить shutdown с ключом -F.